組織・事務分掌は、次のとおりで、展示解説・監視や警備・機器管理等の庁舎管理業務は委託で対応した。（2011年5月17日現在　館職員22名　» スタッフ紹介はこちら）

特別館長　東　洋一

館長　前田 洋治

利用サービス室長

室員 7名（事務 4名、嘱託 2名）

• 予算、決算、庶務
• 施設管理運営
• 来館者受付案内、観覧料徴収

学芸・研究系

館員 13名（古生物 9名、教員 1名、学芸員 1名、嘱託 2名）

• 専門分野の調査研究
• 教育普及事業の企画運営
• 博物館情報の管理運営
• 文献、資料等の収集
• 展示の管理運営
• 各種刊行物の出版